NVIDIA 日前表示,上海交通大學魏冬青教授的團隊使用了 5 台 NVIDIA 研發的 DGX-2 AI 超算超算用於尋找抗病毒藥物,篩選效率從之前的 2 個月提升到 2 天,而且發論文的數量也是之前的十多倍。
在對抗新冠病毒的過程中,尋找有效治療藥物是關鍵,現代藥物研發就需要超強的計算能力了, AI 人工智能也是必不可少的。
魏冬青教授帶領研究團隊選擇利用人工智能技術進行分子動力學模擬,在現有小分子藥物(包括 FDA 已批準的藥物)中篩選能夠對新冠病毒起到抑製性作用的藥物,以實現老藥新用,進而可以馬上進行臨床應用。
據魏教授介紹,在藥物篩選過程中,研究團隊需要對幾十萬種分子進行分子動力學模擬計算,麵對如此大規模的計算量,如按照目前常規的算力條件,團隊需要1到2個月的時間才能完成全部模擬。
但是疫情麵前,時間就是生命。最終魏教授的團隊選擇了 5 台 NVIDIA 的 DGX-2 人工智能超算用於此次的研究。
NVIDIA 表示, DGX-2 人工智能超級計算機是 NVIDIA GPU 計算和存儲能力的集大成者,其配置了 16 張 NVIDIA Tesla V100 GPU , 可擴展架構使得模型的複雜性和應用的規模不受傳統架構局限性的限製,由多台 DGX-2 組成的 GPU 集群更是可以輕鬆應對數據科學各種複雜的 AI 和 HPC 挑戰。
NVIDIA 表示,有了超高性能的計算資源助力,再配合先進的醫學研究深度學習軟件, 團隊的藥物研究進程得到了極大地提速,原本需要 1 到 2 個月才能完成的模擬計算,如今隻用 1 到 2 天就完成了 。
不僅工作效率大幅提升, NVIDIA 還強調發表科研成果的速度變了,過去魏教授每三年發表的論文也就是 4-5 篇,最多不超過 10 篇。
借助於 AI 技術的廣泛應用, 現在魏教授帶領團隊在 3 年的時間裏發表了 90 餘篇論文成果,科研進程相比於過去有了極大的提速 。
詳細情況可以參考 NVIDIA 官方發表的博文—— 超強 DGX-2 加速抗新冠病毒藥物研究,助力打贏抗 “ 疫 ”戰
【作者:憲瑞】
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